***************************************************************************************************************************************************** Rat09-20140328 ***************************************************************************************************************************************************** ndm_start - warning: 'Rat09-20140328.xml' was modified since last batch processing mv: overwrite ‘Rat09-20140328.xml’?  ===================================================================================================================================================== Rat09-20140328 - Concatenating data files ===================================================================================================================================================== ndm_concatenate - warning: missing sampling rate for .spots files, will not check wideband vs video durations Rat09-20140328-01-prerun ... Durations: wideband signals 218.60000000 s ndm_concatenate - warning: input file 'Rat09-20140328-01-prerun.spots' not found, skipping this step. video signals s difference 218.6 s  ndm_concatenate - warning: large shift may indicate a problem. Concatenation info ...done Wideband data ...done Events ...done Rat09-20140328-03-run ... Durations: wideband signals 2027.20000000 s ndm_concatenate - warning: input file 'Rat09-20140328-03-run.spots' not found, skipping this step. video signals s difference 2027.2 s  ndm_concatenate - warning: large shift may indicate a problem. Concatenation info ...done Wideband data ...done Events ...done Rat09-20140328-04-postsleep ... Durations: wideband signals 9763.10000000 s ndm_concatenate - warning: input file 'Rat09-20140328-04-postsleep.spots' not found, skipping this step. video signals s difference 9763.1 s  ndm_concatenate - warning: large shift may indicate a problem. Concatenation info ...done Wideband data ...done Events ...done Rat09-20140328-05-postrun ... Durations: wideband signals 651.40000000 s ndm_concatenate - warning: input file 'Rat09-20140328-05-postrun.spots' not found, skipping this step. video signals s difference 651.4 s  ndm_concatenate - warning: large shift may indicate a problem. Concatenation info ...done Wideband data ...done Events ...done  ===================================================================================================================================================== Rat09-20140328 - High-pass filtering ===================================================================================================================================================== Number of channels = 166 Chunk size (bytes) = 536870892 Samples/chunk/channel = 1617081 Window half length = 16 Input file = Rat09-20140328.dat Output file = Rat09-20140328.fil Chunk 1/157 (536870892) ......................................................................................................................................................................###################################################################################################################################################################### Chunk 2/157 (536870892) 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......................................................................................................................................................................###################################################################################################################################################################### Chunk 157/157 (312532848) ......................................................................................................................................................................######################################################################################################################################################################  ===================================================================================================================================================== Rat09-20140328 - Detecting/extracting spikes ===================================================================================================================================================== Processing channels 33,38,32,39,35,36,34,37:41,46,40,47,43,44,42,45:16,25,17,24,18,22,20,21:26,19,28,23,29,27,30,31:13,4,9,2,5,3,1,0:7,14,6,15,8,12,11,10:48,55,49,54,50,53,51,52:56,63,57,62,58,61,59,60:97,102,96,103,99,100,98,101:105,110,104,111,107,108,106,109:80,89,81,88,82,86,84,85:90,83,92,87,93,91,94,95:77,68,73,66,69,67,65,64:71,78,70,79,72,76,75,74:112,119,113,118,114,117,115,116:120,127,121,126,122,125,124 1. Computing thresholds starting at 0 s (= 0 bytes) duration is 120 s (= 796800000 bytes) threshold 118.606000,118.606000,118.606000,118.606000,118.606000,118.606000,118.606000,118.606000:118.606000,118.606000,118.606000,118.606000,118.606000,118.606000,118.606000,118.606000:142.328000,118.606000,118.606000,118.606000,142.328000,118.606000,118.606000,118.606000:118.606000,118.606000,118.606000,118.606000,118.606000,118.606000,118.606000,118.606000:142.328000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000,118.606000,142.328000,118.606000:142.328000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000:118.606000,142.328000,118.606000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000:118.606000,118.606000,118.606000,142.328000,118.606000,118.606000,118.606000,142.328000:118.606000,118.606000,142.328000,118.606000,142.328000,118.606000,118.606000,118.606000:118.606000,118.606000,142.328000,142.328000,118.606000,118.606000,118.606000,118.606000:142.328000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000:142.328000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000:142.328000,118.606000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000:142.328000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000:142.328000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000:142.328000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000,142.328000 2. Extracting spike waveforms (creating .res and .spk files) Number of spikes: - Group 0 = 1147325 - Group 1 = 1234757 - Group 2 = 1210769 - Group 3 = 1715246 - Group 4 = 1682150 - Group 5 = 1788068 - Group 6 = 1517442 - Group 7 = 1509656 - Group 8 = 1265863 - Group 9 = 1193338 - Group 10 = 1323521 - Group 11 = 1336379 - Group 12 = 1839420 - Group 13 = 1884144 - Group 14 = 1936465 - Group 15 = 1450610  ===================================================================================================================================================== Rat09-20140328 - Computing PCA for spike sorting ===================================================================================================================================================== [PCA] 0% .................................................. 100%################################################## [PCA] 0% .................................................. 100%################################################## [PCA] 0% .................................................. 100%################################################## [PCA] 0% .................................................. 100%################################################## [PCA] 0% .................................................. 100%################################################## [PCA] 0% .................................................. 100%################################################## [PCA] 0% .................................................. 100%################################################## [PCA] 0% .................................................. 100%################################################## [PCA] 0% .................................................. 100%################################################## [PCA] 0% .................................................. 100%################################################## [PCA] 0% .................................................. 100%################################################## [PCA] 0% .................................................. 100%################################################## [PCA] 0% .................................................. 100%################################################## [PCA] 0% .................................................. 100%################################################## [PCA] 0% .................................................. 100%################################################## [PCA] 0% .................................................. 100%##################################################  ===================================================================================================================================================== Rat09-20140328 - Creating LFP file ===================================================================================================================================================== Input File : Rat09-20140328.dat Channels : 166 Sampling Rate : 20000.000000 Output file : Rat09-20140328.lfp Sampling Rate : 1250.000000 Freq Ratio : 0.062500 Converter : Fastest Sinc Interpolator Resampling : 0% .................................................. 100%################################################## Output Frames : 15825375